بخش نگهداری آثار مکتوب، شامل دوازدههزار جلد کتاب اعم از کتابهای خطی، سنگی، آثار مکتوب قدیم و معاصر در موضوعاتی مانند قرآن، تفسیر، فقه، اصول، عقاید، کلام، فلسفه، حقوق، حدیث، ادعیه، رجال، تاریخ سرگذشتنامه، ادبیات، واژهنامهها و لغات، جغرافیا، طب اسلامی و... است.